Peptide sequence

Den ordnede kæde af aminosyrerester, der definerer et peptid — forbindelsens faktiske identitet, hvorfra dets formel, masse og adfærd følger.

Et peptid er en kæde af aminosyrer forbundet med amidbindinger, og dets sekvens — hvilke rester, i hvilken rækkefølge — er dets definition. To peptider med de samme rester i forskellige rækkefølger er forskellige forbindelser med forskellige egenskaber. Sekvens er det, et navn som en femlængde kodeforlægning afkorter, og det er inputtet, hvorfra teoretisk molekylvægt og formel beregnes.

Sekvens bestemmer også de egenskaber, der har betydning efterfølgende: hvor mange basiske rester der er, og derfor hvor meget modion saltformen bærer; hvilke nedbrydningsveje molekylet er modtageligt for; og hvilken masse en identitetskontrol bør observere. Når et certifikat sammenligner observeret mod teoretisk masse, er den teoretiske side beregnet ud fra sekvensen.

Modificerede rester komplicerer navngivning, men ikke princippet. Mange forskningspeptider bærer modifikationer — acetylering, amidering, usædvanlige rester, fedtsyresidekæder — og den modificerede sekvens, ikke den oprindelige, er forbindelsens identitet. Dette er en grund til, at registeridentifikatorer har betydning: to produkter solgt under ét handelsnavn kan adskille sig i modifikation, og kun sekvensniveau-identitet, kontrolleret ved masse, skelner dem.

Kun til forskningsformål. Ikke til humant forbrug, diagnose, behandling eller forebyggelse af nogen tilstand. Intet på denne side er medicinsk rådgivning.